La solution Modul-Bio/Maplesoft est retenue pour la découverte de nouvelles molécules

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La solution Modul-Bio/Maplesoft est retenue pour la découverte de nouvelles molécules
jeudi 5 février 2009Description
La découverte de nouvelles molécules demande de très gros efforts de recherche systématique, ainsi que la collecte et l'analyse de très gros volumes de données. Pour automatiser les protocoles de recherche, les LIMS (Laboratory Information Management System) permettent de gérer les résultats d'expériences sur des échantillons en très grands nombre. Les techniques d'analyse et de statistique sont devenues un enjeu capital et l'utilisation de calculs mathématiques pour la construction de ces analyses est maintenant incontournable. En choisissant d'utiliser le logiciel mathématique Maple dans son LIMS, Modul-Bio offre aux laboratoires de créer et d'adapter leurs analyses très rapidement et d'améliorer leur efficacité de recherche de façon considérable.

MBioLIMS de Modul-Bio a été choisi par un institut biologique majeur en Europe pour gérer les données provenant des mesures effectuées par la plateforme robotique de criblage de composés chimiques à haut débit. L'objectif était de trouver un environnement LIMS simple d'utilisation, rapide à mettre en œuvre et puissant.

La nouvelle version de MBioLIMS utilise le moteur de calcul mathématique du logiciel Maple pour réaliser le traitement et les analyses des données. L'ergonomie utilisateur avancée de Maple et sa simplicité d'utilisation en particulier pour la formulation d'équations, permettent à MBioLIMS de mettre en oeuvre rapidement des fonctions de traitement automatisées puissantes et faciles à utiliser.

« MBioLIMS utilise le moteur mathématique Maple pour réaliser tous les calculs et les analyses demandées par le client, à partir des mesures enregistrées, qu'il s'agisse de calcul de variables, de constantes, de tracés de courbes ... Nous avions le choix entre Maple et Matlab. Notre choix s'est porté sur Maple en raison de son ergonomie utilisateur particulièrement conviviale et de la flexibilité d'utilisation des équations.

Maple permet à MBioLIMS de se différencier des autres produits LIMS, qui sont plus fermés, et qui proposent généralement un export Excel, csv pour faire du traitement de données à l'extérieur du LIMS. Les équations Maple sont de plus très faciles à utiliser et à appeler depuis notre code Java. Nous gagnons ainsi beaucoup de temps dans le développement

des adaptations spécifiques de MBioLIMS à chaque client, l'utilisateur peut décider lui-même de sa propre équation et formule» nous dit M. JACOTOT, Président de Modul-Bio.

La plateforme robotique est composée de deux robots de micro pipetage Tecan et de deux spectrophotomètres. Elle est utilisée pour faire du criblage de composés chimiques, plus précisément pour réaliser des tests enzymatiques dans le but de rechercher et de classer des molécules inhibitrices.

De gros volumes de données sont produits par les appareils de lecture Tecan et stockés automatiquement dans la base de données Oracle du LIMS. Le logiciel MBioLIMS de Modul-Bio y est utilisé pour gérer, traiter et analyser ces données. Il est accessible, depuis tout PC ou MAC connecté au réseau interne, par une interface web utilisant un serveur d'application JAVA.

Avec MBioLIMS, les instituts biologiques ou pharmaceutiques bénéficient d'un outil particulièrement ergonomique de gestion de leur données. L'intégration du moteur de calcul Maple permet de bénéficier de fonctions de traitement et d'analyses automatiques très faciles à utiliser sur des volumes importants de données. Des fonctions de recherche sont également proposées. Le système de requête de MBioLIMS permet d'interroger la base de données, par exemple en entrant le pourcentage d'inhibition voulu, on trouve les molécules correspondantes avec une visualisation 2 D des structures chimiques.

La plateforme robotique est composée de deux robots de micro pipetage Tecan et de deux spectrophotomètres. Elle est utilisée pour faire du criblage de composés chimiques, plus précisément pour réaliser des tests enzymatiques dans le but de rechercher et de classer des molécules inhibitrices. De gros volumes de données sont produits par les appareils de lecture Tecan et stockés automatiquement dans la base de données Oracle du LIMS. Le logiciel MBioLIMS de Modul-Bio y est utilisé pour gérer, traiter et analyser ces données. Il est accessible, depuis tout PC ou MAC connecté au réseau interne, par une interface web utilisant un serveur d'application JAVA.

Avec MBioLIMS, les instituts biologiques ou pharmaceutiques bénéficient d'un outil particulièrement ergonomique de gestion de leur données. L'intégration du moteur de calcul Maple permet de bénéficier de fonctions de traitement et d'analyses automatiques très faciles à utiliser sur des volumes importants de données. Des fonctions de recherche sont également proposées. Le système de requête de MBioLIMS permet d'interroger la base de données, par exemple en entrant le pourcentage d'inhibition voulu, on trouve les molécules correspondantes avec une visualisation 2 D des structures chimiques.

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